Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MSMO1Q15800 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MSMO1Q15800 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms