Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NCOA1Q15788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
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NCOA1Q15788 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
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NCOA1Q15788 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
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NCOA1Q15788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
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NCOA1Q15788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NCOA1Q15788 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
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