Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF1Q15637 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF1Q15637 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF1Q15637 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SF1Q15637 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SF1Q15637 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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