Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAM1Q15629 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM1Q15629 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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