Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAB35Q15286 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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RAB35Q15286 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB35Q15286 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB35Q15286 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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RAB35Q15286 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB35Q15286 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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