Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PCOLCEQ15113 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PCOLCEQ15113 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms