Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLD3Q15054 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLD3Q15054 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms