Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MLC1Q15049 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
MLC1Q15049 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms