Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB3GAP1Q15042 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB3GAP1Q15042 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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