Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAM2Q15035 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAM2Q15035 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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