Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHPRHQ149N8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SHPRHQ149N8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms