Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR1I3Q14994 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR1I3Q14994 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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