Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBM39Q14498 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBM39Q14498 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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