Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CSHL1Q14406 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CSHL1Q14406 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
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