Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CKAP5Q14008 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CKAP5Q14008 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CKAP5Q14008 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CKAP5Q14008 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CKAP5Q14008 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CKAP5Q14008 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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