Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTAN1Q13813 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
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