Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ITGA9Q13797 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ITGA9Q13797 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITGA9Q13797 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGA9Q13797 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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