Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RUNX3Q13761 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RUNX3Q13761 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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