Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALCAMQ13740 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ALCAMQ13740 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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