Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDAC1Q13547 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDAC1Q13547 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms