Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C1orf61Q13536 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C1orf61Q13536 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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