Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBB3Q13509 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TUBB3Q13509 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBB3Q13509 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
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