Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLF1Q13351 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF1Q13351 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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