Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CALCOCO2Q13137 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CALCOCO2Q13137 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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