Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RESTQ13127 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RESTQ13127 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RESTQ13127 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RESTQ13127 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RESTQ13127 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RESTQ13127 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RESTQ13127 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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