Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRDM2Q13029 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRDM2Q13029 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRDM2Q13029 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
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