Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CNTN1Q12860 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CNTN1Q12860 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CNTN1Q12860 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CNTN1Q12860 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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