Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BPTFQ12830 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BPTFQ12830 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPTFQ12830 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPTFQ12830 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPTFQ12830 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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