Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 RPA12YJR063W 378 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 VMA5YKL080W 1179 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 FAR3YMR052W 615 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 XRS2YDR369C 2565 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 TRM82YDR165W 1335 nt3.44□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SKN7YHR206W 1869 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 AEP1YMR064W 1557 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YPR022CYPR022C 3402 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 STU1YBL034C 4542 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MRPL11YDL202W 750 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SMX2YFL017W-A 234 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YPT6YLR262C 648 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YPT7YML001W 627 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YSF3YNL138W-A 258 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YNL184CYNL184C 327 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 APD1YBR151W 951 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 ARL1YBR164C 552 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SRP1YNL189W 1629 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 KRI1YNL308C 1776 nt3.43□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 UBP5YER144C 2418 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 VPS53YJL029C 2469 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 RED1YLR263W 2484 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YCR085WYCR085W 354 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 NRG1YDR043C 696 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 AIM11YER093C-A 414 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 GTT2YLL060C 702 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YLR050CYLR050C 486 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YLR217WYLR217W 324 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SUB1YMR039C 879 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 RIB4YOL143C 510 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 PEX27YOR193W 1131 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 URK1YNR012W 1506 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MRH4YGL064C 1686 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 VPS38YLR360W 1320 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YMR046CYMR046C 1323 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.42□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 CIN1YOR349W 3045 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SYO1YDL063C 1863 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 STE2YFL026W 1296 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YGR073CYGR073C 372 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 GOS1YHL031C 672 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 INO4YOL108C 456 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 VAM10YOR068C 345 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SME1YOR159C 285 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 GPI13YLL031C 3054 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 MNT4YNR059W 1743 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 TPO5YKL174C 1857 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 SSM4YIL030C 3960 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 ATG26YLR189C 3597 nt3.41□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 CDC40YDR364C 1368 nt3.4□□□□□ -1.86
NMD4Q12129 YDL050CYDL050C 372 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RMD6YEL072W 696 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 THO1YER063W 657 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YJL032WYJL032W 315 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 ATG10YLL042C 504 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 LIP2YLR239C 987 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPL6BYLR448W 531 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 TPT1YOL102C 693 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MDM36YPR083W 1740 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YBR137WYBR137W 540 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RAD26YJR035W 3258 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 DAN4YJR151C 3486 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YPS6YIR039C 1614 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MPS1YDL028C 2295 nt3.4□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 OSH3YHR073W 2991 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 GPM2YDL021W 936 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YEA4YEL004W 1029 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YGR115CYGR115C 780 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 BCD1YHR040W 1101 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 EST3YIL009C-A 546 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RIM11YMR139W 1113 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YOL114CYOL114C 609 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 LTP1YPR073C 486 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 SCD6YPR129W 1050 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 SRP68YPL243W 1800 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 NDC80YIL144W 2076 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 VPS33YLR396C 2076 nt3.39□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RSF2YJR127C 4143 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 VBA4YDR119W 2307 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 TDA1YMR291W 1761 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 FMN1YDR236C 657 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 PIR1YKL164C 1026 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RRG7YOR305W 729 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YBR259WYBR259W 2067 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 URA2YJL130C 6645 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 NOP56YLR197W 1515 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YNL011CYNL011C 1335 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RAD2YGR258C 3096 nt3.38□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 JEN1YKL217W 1851 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 RPN2YIL075C 2838 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 ATG21YPL100W 1491 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 VAC14YLR386W 2643 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 MGT1YDL200C 567 nt3.37□□□□□ -1.87
NMD4Q12129 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 108 ms