Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CGNL1Q0VF96 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CGNL1Q0VF96 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CGNL1Q0VF96 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms