Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SYCNQ0VAF6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms