Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLFN5Q08AF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLFN5Q08AF3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms