Protein–RNA interactions for Protein: Q08685

CLP1, mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLP1Q08685 THP2YHR167W 786 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YLR076CYLR076C 423 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SYC1YOR179C 567 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 MCA1YOR197W 1299 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 PNT1YOR266W 1272 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SPS4YOR313C 1017 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 NMD2YHR077C 3270 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 EAP1YKL204W 1899 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 TRS130YMR218C 3309 nt2.88□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 MET5YJR137C 4329 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 JJJ1YNL227C 1773 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 VPS64YDR200C 1815 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 THO1YER063W 657 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 ADH4YGL256W 1149 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 PRP18YGR006W 756 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YLL047WYLL047W 384 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SIC1YLR079W 855 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 LCL1YPL056C 306 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 RPL33AYPL143W 324 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 TPO5YKL174C 1857 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SEC27YGL137W 2670 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 CLB5YPR120C 1308 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 DYN1YKR054C 12279 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 TOP2YNL088W 4287 nt2.87□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YDL199CYDL199C 2064 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 ILS1YBL076C 3219 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 POP6YGR030C 477 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 CAB2YIL083C 1098 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 RPC17YJL011C 486 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 TFA2YKR062W 987 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 TDA8YAL064C-A 381 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SAM37YMR060C 984 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 MRPL33YMR286W 261 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 RPL20BYOR312C 519 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 ACM1YPL267W 630 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SNQ2YDR011W 4506 nt2.86□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 VHR2YER064C 1518 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 MSS2YDL107W 1056 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 GCD6YDR211W 2139 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 AIM11YER093C-A 414 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YLR365WYLR365W 333 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 HNT3YOR258W 654 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 RPS11BYBR048W 471 nt2.85□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SGM1YJR134C 2124 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YDR222WYDR222W 1248 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 HYP2YEL034W 474 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 DOG1YHR044C 741 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 DID4YKL002W 699 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 DAD2YKR083C 402 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 SEC14YMR079W 915 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YBL094CYBL094C 333 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 PBP2YBR233W 1242 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 IPI3YNL182C 1668 nt2.84□□□□□ -1.95
CLP1Q08685 YLR278CYLR278C 4026 nt2.84□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 CLN2YPL256C 1638 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SGS1YMR190C 4344 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YGR149WYGR149W 1299 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YJR020WYJR020W 333 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YKR033CYKR033C 426 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SFH1YLR321C 1281 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PSY3YLR376C 729 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 MPP6YNR024W 561 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YOL166CYOL166C 339 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YOR314WYOR314W 330 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 DIM1YPL266W 957 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.83□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 UBP14YBR058C 2346 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YDR336WYDR336W 945 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 EBP2YKL172W 1284 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YMR178WYMR178W 825 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 TEX1YNL253W 1269 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PIS1YPR113W 663 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 DUN1YDL101C 1542 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YHR078WYHR078W 1659 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YKU80YMR106C 1890 nt2.82□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SMY2YBR172C 2223 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 BPT1YLL015W 4680 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 snR70snR70 164 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PEF1YGR058W 1008 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 QCR10YHR001W-A 234 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 IMP3YHR148W 552 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YAR069CYAR069C 294 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YLR297WYLR297W 390 nt2.81□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 BNI4YNL233W 2679 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 SPH1YLR313C 1593 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PBI1YPL272C 1554 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 PCL2YDL127W 927 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YDR290WYDR290W 330 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 DDI2YFL061W 678 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YGR039WYGR039W 312 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YMR310CYMR310C 954 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 DDI3YNL335W 678 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 YOR062CYOR062C 807 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 IAH1YOR126C 717 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 TAF3YPL011C 1062 nt2.8□□□□□ -1.96
CLP1Q08685 UBS1YBR165W 834 nt2.8□□□□□ -1.96
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