Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNB2Q08289 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNB2Q08289 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms