Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SRSF4Q08170 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF4Q08170 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms