Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLEQ07864 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLEQ07864 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLEQ07864 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLEQ07864 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLEQ07864 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLEQ07864 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms