Protein–RNA interactions for Protein: Q07084

SSK1, Osmolarity two-component system protein SSK1, yeastyeast

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK1Q07084 MRS2YOR334W 1413 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 NRG1YDR043C 696 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 VAB2YEL005C 849 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 LOC1YFR001W 615 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MST27YGL051W 705 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MST28YAR033W 705 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 FAR3YMR052W 615 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ATP11YNL315C 957 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YOR203WYOR203W 354 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RPA43YOR340C 981 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RET3YPL010W 570 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 NAT1YDL040C 2565 nt3.31□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CIK1YMR198W 1785 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YKL050CYKL050C 2769 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SRP1YNL189W 1629 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YLR352WYLR352W 2424 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ARP5YNL059C 2268 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YDR271CYDR271C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MFA1YDR461W 111 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 DPH1YIL103W 1278 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 PRP21YJL203W 843 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 BET5YML077W 480 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RAD14YMR201C 1116 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YOR283WYOR283W 693 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SEA4YBL104C 3117 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 PMT6YGR199W 2280 nt3.3□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CTF13YMR094W 1437 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YBP2YGL060W 1926 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 KIN4YOR233W 2403 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 RTT109YLL002W 1311 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 NSE4YDL105W 1209 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CRD1YDL142C 852 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 EMC4YGL231C 573 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 EFG1YGR271C-A 702 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 IST3YIR005W 447 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SOD1YJR104C 465 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YKL115CYKL115C 393 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SDS22YKL193C 1017 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ERP1YAR002C-A 660 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 COQ5YML110C 924 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 IRC21YMR073C 606 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YNR062CYNR062C 984 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CDC45YLR103C 1953 nt3.29□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 EXO70YJL085W 1872 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 KRE2YDR483W 1329 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ERG9YHR190W 1335 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 OCA6YDR067C 675 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 KEI1YDR367W 666 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 COBQ0105 1158 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 CNN1YFR046C 1086 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 GOS1YHL031C 672 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ATG27YJL178C 816 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 BUD19YJL188C 309 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 ANB1YJR047C 474 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 MBR1YKL093W 1020 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 LDS2YOL047C 1071 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YPL088WYPL088W 1029 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 OAF3YKR064W 2592 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 YJR030CYJR030C 2238 nt3.28□□□□□ -1.88
SSK1Q07084 SHE9YDR393W 1371 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 VPS17YOR132W 1656 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 HEF3YNL014W 3135 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 CWC2YDL209C 1020 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 UPF3YGR072W 1164 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RLP7YNL002C 969 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 GIM3YNL153C 390 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PRP22YER013W 3438 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PWP2YCR057C 2772 nt3.27□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 TRM82YDR165W 1335 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SPA2YLL021W 4401 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SMC3YJL074C 3693 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 BYE1YKL005C 1785 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 NUP85YJR042W 2235 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 DTD1YDL219W 453 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YFL015CYFL015C 495 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YGR126WYGR126W 693 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 QCR10YHR001W-A 234 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YIR014WYIR014W 729 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YJL114WYJL114W 681 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SFT1YKL006C-A 294 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YKR011CYKR011C 1062 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 ATG10YLL042C 504 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PRM6YML047C 1059 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RIM11YMR139W 1113 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 YOL029CYOL029C 606 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 DER1YBR201W 636 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 ADF1YCL058W-A 342 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 VPS33YLR396C 2076 nt3.26□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SEC6YIL068C 2418 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 STP1YDR463W 1560 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 IMD4YML056C 1575 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 FUN12YAL035W 3009 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 SLF1YDR515W 1344 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 PDR12YPL058C 4536 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 CLB3YDL155W 1284 nt3.25□□□□□ -1.89
SSK1Q07084 RSM28YDR494W 1086 nt3.25□□□□□ -1.89
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