Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKCZQ05513 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKCZQ05513 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKCZQ05513 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms