Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SSBP1Q04837 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms