Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRB3Q04118 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRB3Q04118 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms