Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNT1Q02742 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT1Q02742 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms