Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DSG1Q02413 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DSG1Q02413 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms