Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SATB1Q01826 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SATB1Q01826 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms