Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MC1RQ01726 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MC1RQ01726 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms