Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SCN7AQ01118 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCN7AQ01118 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms