Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEX3Q00994 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEX3Q00994 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms