Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HSF1Q00613 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HSF1Q00613 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms