Protein–RNA interactions for Protein: P84085

ARF5, ADP-ribosylation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF5P84085 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARF5P84085 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARF5P84085 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF5P84085 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF5P84085 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF5P84085 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARF5P84085 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARF5P84085 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARF5P84085 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARF5P84085 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms