Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMAD3P84022 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMAD3P84022 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms