Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBP5P82980 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBP5P82980 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBP5P82980 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms